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人体内通常含有数百种不同种类的细菌，但细菌个数达数万亿个。
这些细菌大多存在于以下地方：
在皮肤和牙齿上
在牙齿和牙龈间的空隙中
在鼻和鼻道、喉咙、肠道和阴道的粘膜处
不同种属存在于不同部位，也提示每一部位不同的生理状况。
它们中的大多数属于厌氧菌——生存和生长过程不需要氧。
通常，这些厌氧菌不致病。许多厌氧菌对人体有益，如帮助分解肠道内的食物。
但是，如果粘膜受损，厌氧细菌会引起疾病。细菌可以进入其生存范围之外且对其无抵御能力的组织。细菌可以感染临近器官（如鼻窦、中耳、肺、脑、腹腔、骨盆及皮肤）或侵入血液系统四处播散。
