（参见 肠道原虫和微孢子虫感染概述 肠道原虫和微孢子虫感染概述 原生动物是某些有核单细胞生物（真核生物）的松散术语，这些生物缺乏细胞壁，既不是动物、植物，也不是真菌。引起人类肠道感染的最重要的肠道原生动物病原体包括 隐孢子虫属（见 隐孢子虫病） Cyclospora cayetanensis... Common.TooltipReadMore 。）
微孢子虫是专性细胞内孢子形成寄生虫，是真菌或与其密切相关的寄生虫。 微孢子虫过去被归类为原生动物。
在 > 1,400种微孢子虫中，至少15种与人类疾病有关。一般通过以下途径感染其孢子：
消化道摄入
呼吸道吸入
直接接触结膜
接触动物
人际传播。
在宿主体内，它们用极小管或细丝捕获宿主细胞，并注入感染性孢原质将其感染。在细胞内，孢原质分裂增殖，产生成孢子细胞进而发育为孢子。孢子可全身播散，或通过呼出的气溶胶、粪便或尿液被排出到环境中。孢子从宿主细胞中释出时可导致炎症反应。
对人感染的传染途径及可能的保虫宿主知之甚少。
微孢子虫可能是健康人出现亚临床或轻度自限性疾病的常见原因，但在AIDS出现前的年代，仅仅只有少量感染病例被报道，可能是由于对该病的认识不足导致。近年来，微孢子虫角膜结膜炎在免疫缺陷人群中越来越多地被报道。
微孢子虫是 AIDS 人类免疫缺陷病毒感染 由人免疫缺陷病毒（HIV）的两类相似的反转录病毒（HIV-1和HIV-2）感染引起CD4+T细胞损伤和细胞免疫功能破坏，进而导致发生某些感染和肿瘤的危险性增加。最初的感染可能导致不典型的发热性疾病。之后，由HIV感染所带来的疾病风险取决于免疫缺陷的程度，也即CD4+T淋巴细胞的减低程度。病毒可直接损... Common.TooltipReadMore 
患者以及其他免疫抑制患者的机会性感染的病原体之一，但后者的发病少于前者。Encephalitozoon species including E. bieneusi 肠脑微孢子虫和E. （以前称为Septata间隔微孢子虫）和比氏肠胞微孢子虫intestinalis可在CD4+T淋巴细胞计数<100/mcL和AIDS患者中导致慢性腹泻。根据宿主的物种和免疫状态，一些 微孢子虫, 鼻息肉, 维塔福马等属可感染眼睛、肝脏、胆道、鼻窦、肌肉、呼吸道、泌尿生殖系统、中枢神经系统，偶见引起播散性疾病。
随着有效抗逆转录病毒疗法的广泛使用，AIDS 患者中微孢子虫病的发病率已大幅下降。
微孢子虫病的症状和体征
微孢子虫引起的临床表现可不同，取决于。
寄生的具体种类
宿主的免疫状态
免疫正常者，微孢子虫可引起无症状感染或自限性水样腹泻。有报道称眼部感染可引起角膜结膜炎。
在AIDS患者中，多种微孢子虫可引起慢性腹泻、 吸收不良 吸收不良综合征概述 吸收不良综合征是指由于消化、吸收或物质转运障碍而导致的食源性营养物质吸收不足的一类疾病。 常量营养物质（如蛋白质、碳水化合物、脂肪）和/或微量营养素（如维生素、矿物质）吸收不良，引起大便增多、营养不良和胃肠道症状。吸收不良包括：累及几乎所有营养物质的完全性吸收不良和某种特定营养物质的部分性吸收不良。... Common.TooltipReadMore 、消瘦、胆管炎、点状角膜结膜炎、腹膜炎、肝炎、肌炎或鼻窦炎。肾脏和胆囊也可受累。角膜微孢子虫和另几种可导致眼睛感染，可表现为从红肿和刺痛的点状角膜结膜炎到严重的、危及视力的 间质性角膜炎 角膜基质炎 角膜基质炎是指角膜中基层（即角膜的中间层）的慢性、非溃疡性炎症，有时伴有葡萄膜炎。病因通常是感染性的。症状为畏光、疼痛、流泪和视力模糊。诊断依靠裂隙灯检查，血清学检查可以明确病因。治疗针对病因，可能需要局部皮质类固醇。 角膜基质炎是某些角膜感染的另外一种表现形式，在美国罕见。 大部分病例是作为 先天性梅毒的一种晚期并发症发生在患儿或者青少年，最终双眼都可受到累及。 Cogan综合征、... Common.TooltipReadMore 
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微孢子虫病的诊断
使用特殊染色的光学或电子显微镜检查。
有时基于免疫荧光或聚合酶链反应 (PCR) 的检测
通过活检或粪便、尿液、脑脊液（CSF）、痰液或角膜刮片获得的受感染组织样本中可显示感染的病原体。经特殊染色方法很易观察到微孢子虫。在组织和涂片中可应用荧光增强剂（荧光染料）进行快速检测。快-热革兰染色方法最快。
免疫荧光试验和基于PCR的检测手段可在专业实验室内进行。
透射电镜是目前最敏感的检测方法，但对常规诊断不可行。
分子方法用于物种形成。
微孢子虫病的治疗
对于艾滋病患者，启动并优化抗反转录病毒疗法（ART）
对于胃肠、皮肤、肌肉、或播散微孢子病，可口服阿苯达唑或烟曲霉素（如可及），根据感染的物种而定
对于角膜结膜炎，口服阿苯达唑和外用烟曲霉素
对于艾滋病患者，及时启动或优化 抗反转录病毒治疗 HIV 感染的抗逆转录病毒治疗 由于疾病相关的并发症可发生在未经治疗的高CD4计数的患者中，同时因为毒性较低的药物已经研发上市，因此目前所有的HIV感染者均推荐采用抗逆转录病毒治疗（ART）。在已开展的那些可靠的临床研究证实，ART的益处要胜过它所带来的风险。 抗病毒目标 血浆HIV RNA降低至不可检测的水平（即， CD4细胞计数恢复到正常水平（免疫恢复或重建） 若患者服用抗病毒药物的依从性 > 95％，抗病毒治疗可以达到既定的目标。 Common.TooltipReadMore 
很重要。抗菌治疗的持续时间和结果取决于使用ART后患者免疫重建的水平。
微孢子虫病的抗微生物治疗取决于感染的微孢子虫种类，宿主的免疫状态以及受累器官。关于治疗方案选择的数据是有限的。建议咨询传染病专家。
阿苯达唑是一种苯并咪唑类广谱驱虫药，用于治疗某些微孢子虫的感染，但它可能会产生严重的副作用，包括10%的患者出现肝损伤（肝炎），很少出现白细胞计数低的情况。
阿苯达唑（成人每日2次口服400 mg，儿童每日2次，每次7.5 mg/kg，持续2至4周）通常能有效控制因溶组织内阿米巴和其他易感微孢子虫引起的肠道或播散性感染患者的腹泻。免疫功能正常患者的此类感染可能会自发消退或在治疗一周后消退。
阿苯达唑对别氏大肠杆菌的治疗效果欠佳。 阿苯达唑（成人每天2次400毫克，儿童每天2次7.5毫克/千克，持续2-4周）已用于治疗皮肤、肌肉或因溶组织内阿米巴和其他易感微孢子虫引起的播散性微孢子虫病。
口服烟曲霉素20mg每日3次共14日，已用于比氏肠微孢虫E. bieneusi肠道感染，但它有潜在的严重不良反应，包括在高达一半的患者中可出现严重但可逆的血小板减少症。在美国无口服制剂供应。
阿苯达唑400mg po bid联合福马西林滴眼液可治疗眼部微孢子虫性角膜结膜炎。外用氟喹诺酮，以及伏立康唑类药物，在一些患者中是有效的。当局部和全身治疗无效时，可考虑角膜移植术。该病在免疫正常的患者中预后良好；AIDS患者则取决于ART后免疫重建的水平。
关键点
微孢子主要发生在免疫缺陷患者，主要是AIDS患者，但健康人群中患角膜结膜炎的人数越来越多地被报道。
微孢子虫的孢子可通过摄入、吸入、结膜直接接触、接触动物或人际间直接传播。
症状表现取决于感染的病原体类型及患者的免疫状况，但可发生慢性腹泻、吸收不良、消耗、胆管炎、点状角膜结膜炎、腹膜炎、肝炎、肌炎或鼻窦炎。
利用光学或电子显微镜观察特殊染色标本可诊断；免疫荧光试验以及基于PCR的检测方法可在专业实验室中进行。
对于艾滋病患者，及时启动或优化ART治疗是最重要的。
阿苯达唑口服加上烟曲霉素口服或局部应用可治疗，疗效取决于病原体种类和累及的器官；美国无口服的烟曲霉素制剂。
