在口腔及其邻近结构中可能会发现提示全身性疾病的线索（见牙科患者导言和表）。当怀疑存在全身性疾病时、当患者正在服用某些药物（如华法林、双膦酸盐）时，以及必须评估患者承受全身麻醉或大范围口腔手术的能力时，牙医应咨询内科医生。
患有某些心脏疾病的患者在接受某些牙科操作前可能需要预防性使用抗生素，以帮助预防细菌性心内膜炎（见表，也见表）。
系统性疾病的口腔表现
口腔表现 | 伴随的疾病 |
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鹅口疮（口腔念珠菌病） | 糖尿病，AIDS，其他原因的免疫抑制状态（如粒细胞缺乏症，中性粒细胞减少症，白血病，免疫球蛋白缺乏，白细胞功能障碍），使用抗生素 |
萎缩性舌炎（因丝状乳头萎缩引起的舌体光滑） | |
口腔黏膜和舌表面疼痛性萎缩，有时伴阿弗他溃疡 | |
洋红舌 | |
黑色素区（非种族特征性因素） | |
齿龈交界处牙龈的线性灰黑色变（铅线） | 铅、银或铋中毒 |
紫色斑 | |
角化的苔藓样斑，有时伴疼痛性黏膜萎缩 | 移植物抗宿主疾病（如果发生于移植病人的口腔） |
牙齿红色变 | |
高拱软腭 | |
切牙切迹，圆顶样或桑葚样磨牙 | |
毛状白斑（位于舌侧缘的白色垂直皱褶） | HIV转化成AIDS |
口腔毛细血管扩张的红色或紫红色斑块 | 遗传性出血性毛细血管扩张症（奥-韦-朗综合征） |
多发性阻生的多生牙和骨瘤 | |
呈鹅卵石样表现的肉芽肿性牙龈炎 |
伴有全身系统性疾病患者的牙科护理
某些医疗状况（及其治疗）会使患者易患牙科问题或影响牙科治疗。
血液病
凝血障碍疾病患者（例如血友病、急性白血病、血小板减少症）进行可能引起出血的口腔操作（如拔牙、下颌神经阻滞麻醉、洁治术）时需要咨询相关学科的医师。血友病患者在拔牙以及需要局部麻醉的牙体修复（如充填）前、中、后期均应使用凝血因子。大多数血液科医生建议血友病患者，尤其是那些已产生凝血因子抑制物的患者，在进行牙体修复时应接受局部浸润麻醉而不是阻滞麻醉。
牙体修复治疗可在咨询血液科医生后于牙科诊所内完成；然而，如果患者有凝血因子VIII抑制物，该牙科治疗应在医院内全身麻醉下进行。口腔手术应在综合医院进行并根据病情咨询血液科医师相关内容。所有出血性疾病患者应终身常规或定期进行口腔随访，诊治内容包括洁治、充填、表面涂氟和预防性窝沟封闭以避免拔牙。
心血管疾病
如果病情允许，心肌梗死后6个月内，应避免口腔科操作，以利于损伤的心肌恢复电稳定。患有肺部或心脏疾病的患者，如果在牙科操作中需要吸入麻醉，应予以住院。
心内膜炎预防只在以下患者的口腔处理前进行
人工心脏瓣膜或用于心脏瓣膜修复的人工材料
有细菌性心内膜炎病史者
未纠治的发绀型先天性心脏病（包括姑息性分流和导管）
使用人工材料或装置彻底修复的先天性心脏缺损（术后6个月内）
修复后的先天性心脏病，在人工补片或人工装置部位或邻近部位有残余缺损
具有瓣膜病变的心脏移植患者
接受牙科治疗（配合预防措施）比不接受治疗能更好地保护心脏免受慢性牙科疾病中发生的低度菌血症的影响。将要进行心瓣膜手术或修复先天性心脏缺损的患者应该于手术前完成必须的口腔科治疗。
尽管预防作用有限，但血液透析和2年内接受大关节（髋、膝、肩、肘）修复手术者口腔创伤性治疗时推荐预防性使用抗生素。这些部位感染的微生物大都来源于皮肤而非口腔。
局麻药中加入拟肾上腺素药如肾上腺素或左旋去甲异肾上腺素可以延长麻醉的时间。在某些心血管患者中，过量使用这些药物会导致心律不齐，心肌缺血或高血压。普通麻醉剂可用于< 45分钟的手术，但在更长时间的手术或需要止血的手术中，最高0.04 mg肾上腺素（2剂含1：100,000肾上腺素的牙科药弹）被认为是安全的。通常，健康的患者在任何一次就诊时都不应接受 >0.2 mg的肾上腺素。 肾上腺素（任何剂量）的绝对禁忌症是未控制的甲状腺功能亢进，嗜铬细胞瘤，收缩压 > 200 mmHg或舒张压 > 115 mmHg; 药物治疗未控制的心律失常；不稳定型心绞痛，心肌梗塞或6个月内的卒中。
某些口腔科电器设备，例如，手术电刀、牙髓测量仪、超声洁治器，可能干扰早期的心脏起搏器。
癌症
拔除邻近牙龈、上腭或上颌窦癌肿的牙齿，会促进肿瘤侵犯牙槽窝。因此，只有在进行根治性治疗期间才应拔除牙齿。白血病或粒细胞缺乏症患者，即使使用抗生素，拔牙后仍可能继发感染。
免疫抑制治疗
内分泌疾病
神经性疾病
具有癫痫发作病史的患者牙齿矫正时应该使用无法吞入或吸入的固定矫治器。 不能刷牙或有效使用牙线者，可用0.12％氯己定漱口液早晚漱口。 在美国以外的许多国家，氯己定含漱液的浓度为0.2％。然而，这种较高的浓度尚未证明对牙龈健康更有效，可能导致牙齿着色增加。
阻塞性睡眠呼吸暂停
不能耐受持续气道正压通气（CPAP）或双层PAP（BiPAP）面罩治疗的阻塞性睡眠呼吸暂停患者，有时需使用扩大口咽部的口内装置进行治疗。这种治疗方法不如CPAP有效，但是有更多的患者可以耐受。
Medications（药物应用史）
某些药物，如皮质类固醇、免疫抑制剂和化疗药物，使机体愈合能力和抵抗力下降。如果病情允许，这些药物使用期间避免进行口腔治疗。
许多药物会引起口干（口干症），这是一个显著的健康问题，尤其是对于老年患者。致病药物通常具有抗胆碱能作用，包括某些抗抑郁药、抗精神病药、利尿药、抗高血压药、抗焦虑药和镇静药、非甾体类抗炎药（NSAIDs）、抗组胺药和阿片类镇痛药。
某些抗肿瘤药物（如多柔比星、5-氟尿嘧啶、博来霉素、放线菌素D、阿糖胞苷、甲氨蝶呤）可引起口炎，既往患有牙周疾病的患者病情会更严重。这些药物使用前，应该先完成口腔预防措施，指导患者合理刷牙和正确使用牙线。
影响凝血的药物应于手术前减量或停止。服用阿司匹林、非甾体类抗炎药（NSAIDs）或氯吡格雷的患者应该在口腔手术前4天停药，并在出血停止后恢复用药。大多数口服抗凝血药的患者若国际标准化比值（INR）保持稳定且<4，进行门诊牙科手术（包括拔牙）前不需要停药，因为显著出血的风险非常小，而暂时停用口服抗凝药可能会增加血栓形成的风险。对于接受血液透析的患者，口腔治疗应该在透析后1天、肝素化消退时进行。
苯妥英钠、环孢菌素和钙通道阻滞剂，尤其是硝苯地平，会引起牙龈增生。 服用苯妥英钠的患者牙龈增生的发生率为50％，服用环孢素或钙通道阻断剂的患者发生率为25％。但是，良好的口腔清洁及定期洁治能使增生程度最小。
拔牙后，双膦酸盐可能导致药物相关性颌骨坏死（ONJ）。ONJ主要发生在肠外途径给予双膦酸盐治疗骨癌时，而在口服双膦酸盐预防骨质疏松时发生率要低得多（ONJ风险约为0.1%）。勤勉的口腔卫生习惯和定期的牙齿护理可能有助于降低ONJ的风险，但目前尚无经过验证的技术来确定哪些人有发生药物相关性ONJ的风险。停止双膦酸盐治疗可能无法降低这种风险，反而会增加骨质疏松患者骨丧失的可能。
放疗
从受照射的组织中拔牙（特别是如果总剂量为 > 65 Gy，尤其是下颌骨）可能会导致颌骨放射性骨坏死，因此应避免。 这是一种灾难性的并发症，其中拔牙部位破裂，经常使骨骼和软组织脱落。 为了帮助避免这种潜在的并发症，患者应在接受头颈部放射治疗之前完成任何必要的牙科治疗，并留出时间愈合。无法保留的牙齿应予以拔除。应使用必要的窝沟封闭剂和局部氟化物。放疗后，尽量避免拔牙，如若可能，对患牙采用修复术。 有时需要进行根管治疗，然后将牙齿打磨到牙龈线以下以防止骨质萎缩。 如果放疗后需要拔牙，10～20次高压氧治疗可以防治放射性骨坏死。
经验与提示
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头颈部放疗常损伤涎腺组织，引起永久性的口干症，促进龋齿发展。因此，患者必须终生保持良好的口腔卫生。应每天使用氟化物凝胶和含氟漱口水。如果能够耐受，可以在早晨和睡前用0.12％的洗必泰漱口30至60秒。利多卡因能够缓解敏感症状，其凝胶使用后有利于口腔组织敏感的患者进行刷牙、使用牙线和进食。
必须根据上一次的检查结果，每隔3、4或6个月去看牙医。放疗后基托下的组织容易破损，因此，如果感觉不适，应及时检查和修改基托。 早期龋病也可通过磷酸多肽钙和无定形磷酸钙逆转，这些制剂可以由牙医使用，也可以处方给患者在家中使用。
放疗后可能发生口腔黏膜炎症、味觉减弱和咀嚼肌纤维化而导致的张口受限。张口受限可通过训练而改善，方法为：大张口然后闭口，每次20下，每天3～4次。
